小肠平滑肌肉瘤起源于小肠壁的平滑肌组织。国内资料表明，小肠平滑肌肉瘤约占小肠恶性肿瘤的26.2%，仅次于小肠腺癌和恶性淋巴瘤，位居第3位。肿瘤可分布于整个小肠，各段的分布情况各家报道不一，但多数认为发生于空肠者较回肠及十二指肠多见。
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